biochem. AT frage

[Sandra77]

Mich würde der logische Gang hinter dem folgenden Beispiel intressieren:

6. Für folgenden DNA-Doppelstrang
5´ atg cga tta aga gta cca tgc a 3´
3´ tac gct aat tct cat ggt acg t 5´

sollen die Primer (Länge 5 Basen) für eine PCR Reaktion, die ein
Produkt von 15 Basen Länge ergeben gesucht
werden. Welches der folgenden Paare ist richtig:
A) Sense: atgcg 3´ Antisense : tactc 3´
--------
Wie kommt man denn da bitte auf die Lösung?

Hey,

Primer-Searching is funny!
Sense: die ersten 5 Basen vom 5´3´Basenstrang (weil der Primer eine Länge von 5 Basen haben soll) 3´steht für die Richtung, also in die "normale", nicht "anti-Richtung"
Antisense: zu zählst 15 Basen = Produkt von 15 Basen Länge (also 5 Codons (3er Basenpaare)) vom 3´5´Basenstrang, also vom komplementären Strang: und dann die 5 Basen rückwärts! 3´steht wieder für die Richtung, also diesmal in die Gegenrichtung

Ob das die korrekte Vorgehensweise ist kann ich nicht garantieren, ich find´s aber so halbwegs logisch!
Einmal durchgezählt und du merkst dir´s

Viel Lernerfolg noch!